Izvajanje dejavnosti javne veterinarske službe, kakršno mora v okviru strokovne inštitucije zagotavljati vsaka članica Evropske unije.

Inštituti NVI
Inštitut za mikrobiologijo in parazitologijo
V laboratorijih Inštituta za mikrobiologijo in parazitologijo opravljamo diagnostiko kužnih bolezni živali. Opremljeni smo z najsodobnejšimi aparaturami, s katerimi izvajamo več kot 280 mikrobioloških metod.
Inštitut za varno hrano, krmo in okolje
Pedagoško in raziskovalno delo na področju varne hrane, krme, okolja ter dobrobiti in higiene živali.
Vzorčenje, kemijske, mikrobiološke ter mikroskopske analize živil živalskega izvora in krme, olfaktometrijske meritve (analize zraka) in DDD (dezinsekcijo, dezinfekcijo, deratizacijo).
V okviru svojih dejavnosti omogočamo tehnično, strokovno in znanstveno podporo Upravi RS za varno hrano, veterinarstvo in varstvo rastlin, veterinarjem, lastnikom živali, rejcem ter proizvajalcem krme in živil živalskega izvora. Svetujemo na področju prehrane govedi, drobnice, konj, prašičev, perutnine in hišnih ljubljenčkov, kot so psi, mačke in eksotične živali.
Inštitut za patologijo, divjad, ribe in čebele
V okviru Inštituta za patologijo, divjad, ribe in čebele delujeta Enota za patologijo ter sodno in upravno veterinarstvo in Enota za zdravstveno varstvo in gojitev divjadi, čebel in akvakultur.
Inštitut za predklinične vede
Veterinarska morfologija, genetika, biokemija, fiziologija, patofiziologija, farmakologija in toksikologija.
Klinika za reprodukcijo in velike živali
Diagnostika, zdravljenje in preprečevanje bolezni konj, goveda, drobnice in prašičev. Diagnostika in zdravljenje plodnostnih motenj, ter presajanje zarodkov. Vodenje centralnega registra kopitarjev in rodovniških knjig. Preiskave vzorcev krvi, urina, mleka.
Inštitut za perutnino, ptice, male sesalce in plazilce
Na inštitutu v sklopu različnih podenot izvajamo diagnostiko bolezni in rešujemo zdravstveno problematiko v intenzivnih rejah perutnine in pri pticah.