Razpis za mlade raziskovalke in raziskovalce na Univerzi v Ljubljani v letu 2025

1. tema

Kandidat bo opravljal doktorsko delo na področju okoljske toksikologije pri prostoživečih divjih živalih. Raziskovalno delo bo opravljeno v okviru programske skupine P4-0092 “Zdravje živali, okolje in varna hrana” na interdisciplinarnem doktorskem študijskem programu Biomedicina. Kandidat bo raziskoval problematiko biocidnih/pesticidnih preparatov s poudarkom na rodenticidih in izvedel oceno tveganja za zastrupitve s temi substancami v Sloveniji. Tematika je pri nas še neraziskana. Delo bo izrazito interdisciplinarno in bo zajemalo vzorčevanje bioloških materialov na terenu, kemijsko analizno delo v laboratoriju in statistično obdelavo podatkov.

Kandidat se bo izpopolnjeval tudi na partnerskih raziskovalnih organizacijah v tujini.

Opcijska izobrazba kandidata/-tke: veterina (dr. vet med.), kemija oz. biotehnika

Mentorica: znan. svet. dr. Vesna Cerkvenik Flajs

2. tema

Raziskava bo temeljila na proučevanju značilnosti pasjih in konjskih matičnih celic in izvenceličnih veziklov, vzpostavitvi analize zunajceličnih veziklov s pretočno citometrijo, primerjavi terapevtskega potenciala matičnih celic s terapevtskim potencialom veziklov samih in preverjanju možnosti enkapsulacije izvenceličnih veziklov v biomateriale. Namen raziskave bo razvoj celičnega produkta za potencialno klinično uporabo v regenerativni veterinarski medicini.

Program ne vključuje kliničnega dela.

Mentorica: doc. dr. Ana Nemec

3. tema

Mladi raziskovalec se bo usposabljal na Inštitutu za mikrobiologijo in parazitologijo, Laboratorij za molekularno naslednje generacije (NGS). Z metodo NGS bo sekvenciral celokupno DNA iz kompleksnih vzorcev za namen opredelitve sestave mikrobne združbe (mikrobiom) in genov za odpornost proti protimikrobnim zdravilom (rezistom). S sekvenciranjem celotnih genomov bo opredelil genetske značilnosti izbranih klinično relevantnih bakterijskih izolatov.

Mladi raziskovalec bo predvidoma z metagenomskim pristopom v kompleksnih vzorcih iz različnih živinorejskih panog ugotavljal prisotnost potencialnih bakterijskih patogenov in njihovih genov za odpornost. Vzporedno bo prisotnost odpornih bakterij in njihovih genov za odpornost opredelil tudi s klasičnimi gojitvenim pristopom in sekvenciranjem pridobljenih izolatov. Na osnovi zbranih rezultatov bo opredelil tveganje različnih živinorejskih panog kot rezervoarja odpornih bakterij in njihovih genov za odpornost.

Zaželeno je veselje do dela z bioinformacijskimi orodji za analizo podatkov NGS (predznanje zaželeno, ni pa nujno, ključna je pripravljenost za učenje in uporabo teh orodij). Zaželene so tudi izkušnje z delom v mikrobiološkem laboratoriju na področju molekularne mikrobiologije.

Mentor: znan. sod. dr. Bojan Papić

4. tema

Raziskovalno delo se bo osredotočalo na primerjavo zdravljenja različnih pogostejših tumorjev v veterinarski medicini pri psih. Primerjali bomo kirurško zdravljenje in zdravljenje z elektrokemoterapijo in kombinacijo obeh (delno retrospektivno). Poleg klinične primerjave (odgovor na zdravljenje, interval do napredovanja bolezni, preživetje), kar je retrospektivni del študije, bomo izvedli tudi primerjavo s pomočjo aparature za slikanje s toplotno difuzijo (HT Vista) ter določanja nekaterih tumorskih markerjev v krvi zdravljenih psov (Deepscan). Poleg ocenjevanja remisije bolezni z aparaturo za slikanje s toplotno difuzijo, bi s pomočje iste aparature poskusili neinvazivno določiti status varovalne bezgavke.

Zaradi klinične narave dela mora biti kandidat veterinar (dr. vet. med.) z vsaj osnovnim poznavanjem principov veterinarske kirurgije in veterinarske onkologije ter znanjem slovenskega in angleškega jezika vsaj nivoja B2.

Mentorica: znan. sod. dr. Tanja Plavec

5. tema

Raziskovalno delo bo opravljeno v okviru programske skupine P4-0053 Endokrini, imunski in encimski odzivi pri zdravih in bolnih živalih. Kandidat/ka bo proučeval/a fiziološki odziv živali in delovanje naravnih bioloških agensov pri nadzoru kroničnih infekcij pri prežvekovalcih, povzročenih z bakterijami, kot nadomestilo za zdravljenje s protimikrobnimi zdravili. Sodeloval/a bo pri razvoju in preskušanju novih pristopov za razumevanje njihovega delovanja. Raziskovalno delo bo interdisciplinarno in bo zajemalo vzorčene bioloških materialov na terenu, delo v kliničnem in mikrobiološkem laboratoriju ter statistično obdelavo podatkov. Kandidat/ka bo deloval/a in se usposabljal/a tudi na partnerski raziskovalni organizaciji.

Mentor: izr. prof. dr. Ožbalt Podpečan